La Lituanie est délimitée au nord par la Lettonie, à l’est et au sud par la Biélorussie, au sud-ouest par la Pologne et par l’enclave de l’oblast de Kaliningrad (l’ancienne Königsberg) appartenant désormais à la Russie, et à l’ouest par la mer Baltique.
La majeure partie du territoire, située dans le bassin du Niémen, ne dépasse pas 250 m d’altitude. Le pays possède également de vastes étendues de marais, en particulier au nord et à l’est, dont un grand nombre a été drainé.
En 1989, un géographe de l’Institut géographique national français a établi que le centre géographique de l’Europe se trouvait en Lituanie, dans le village de Purnuškes à 26 kilomètres au nord de Vilnius. La méthode se base sur la notion de centre de gravité des territoires européens.